臺涉外部門爆“建交款”遭中間人侵吞疑案，民進黨前主席游錫堃與黨主席候選人蔡同榮4日都主張送廉政委員會調查，不過，黨主席候選人蔡英文認爲，很多細節要有司法調查權的人才能釐清，黨沒有公權力調查能力，不太能釐清真相。
據“中央社”報道，06年涉外部門推動一項建交案，三千萬美元建交款原本存放在中間人吳思材、金紀玖新加坡華僑銀行聯名賬戶中，最後卻流向不明。
蔡英文面對媒體詢問表示，全案進入司法程序，檢察系統正積極調查，很多“外交”事情，外面的人不容易看清楚，司法單位應儘快查清楚，向大衆說明。
民進黨主席候選人辜寬敏說，“外交部長”黃志芳有向陳水扁報告，但這並不是和陳水扁講、報告，責任就完了；“行政院副院長”邱義仁指稱要負全部責任，但他負得起這責任嗎？
至於陳水扁是否該負責？辜寬敏說，“他要不要負責我不曉得，人民對政府的信賴感受了很大的傷害”。
游錫堃表示，這對民進黨聲望是雪上加霜、屋漏偏逢連夜雨，打擊很大，應該要好好處理，邱義仁與黃志芳都坦然願意負責，雖然現在已有司法調查，但黨的調查與政的行政責任調查都應該進行，相關機關該調查就要調查，政治責任要有人負責，黨的廉政委員會也可以啓動。
蔡同榮認爲，這件事對民進黨傷害很大，應送廉政委員會調查，才能維護民進黨形象。
不過，蔡英文說，很多細節要有司法調查權的人才能釐清，黨不太能釐清事情真相。此案是否傷害黨的形象？蔡英文表示，這件事情不能先做太多揣測或論斷，應等司法單位釐清真相，若這件事有問題，黨的問題纔會受到傷害。
“立委”李俊毅說，他覺得邱義仁相當有智慧，所以有智慧的方式是自行退黨、與民進黨切割，如果邱義仁愛臺灣，應該這個時候離開民進黨。
民進黨團幹事長賴清德表示，民進黨於“大選”後非常低迷的士氣，因本案又雪上加霜，黨中央應主動調查本案，該負責的就負責，沒什麼不可以，且由黨中央調查，可儘速讓社會大衆知道全盤情況，比司法速度快，道德標準也會更高，對民進黨是好事。
“立委”蔡煌琅說，邱義仁已說會負起最大責任，邱義仁是有政治風骨的人，事情告一段落後，相信會給黨一個交代；現在最重要是把錢追回，將涉案人抓回來才能降低民進黨形象上的傷害。
