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針對北京市防治非典工作的實際，北京防治非典型肺炎聯合工作小組第九次會議決定，清理規範設立的發熱門診，加強醫療救治工作的標準化，科學配備醫療力量，超前研究防治工作中可能遇到的各種問題。
開展非典防治工作以來，北京市在所有二級以上醫院設立了123家發熱門診，雖然方便了發熱病人的就診，但也存在着條件不具備、管理不規範等問題。不少發熱門診出現了交叉感染，成爲感染源。爲了方便一般疾病患者就醫，又使與非典有關的發燒病人得到及時救治，北京市本着“佈局合理，條件合格”的原則，對發熱門診進行全面整頓規範，制定了《關於進一步加強發熱門診管理的規定》，明確工作標準，要求發熱門診做到“三避免”、“三合格”，即避免普通發熱病人與非典病人交叉感染、避免留觀人員的相互感染、避免非典病人對醫護人員的感染；硬件(隔離條件)合格、軟件(醫護人員)合格、工作流程合格。會議要求對不符合條件的發熱門診停診整頓，並從人口、區域、就診半徑、就醫流量等因素綜合考慮調整醫院佈局，保留63家醫院的發熱門診。
會議要求，設有發熱門診的醫院要設立分診臺，把一般病人和與非典有關的發熱病人分開。不設發熱門診的醫院要設立醒目標誌，引導病人到設有發熱門診的醫院就診，進一步有效切斷傳染源。開設發熱門診的醫院要加強對發熱患者的科學排查，確保對病情診斷的準確性。
提高收治率和治癒率，降低病死率和醫務人員感染率，是影響全局的關鍵問題。會議要求一切措施都要落實到“兩提高兩降低”上來。
會議決定建立北京地區醫院院長聯席會議制度，加強信息溝通和相互協調，保障非典醫療救治工作順利進行。
中共中央政治局委員、北京市委書記、北京防治非典型肺炎聯合工作小組組長劉淇強調，要把困難估計得更多些，切實做到有備無患，把工作做到前頭。從現在起就要對出院病人安置、學生返校及外來務工人員返京等將要面對的問題進行研究，同時要着手研究公共衛生防禦體系建設，爲長遠做準備。
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