我國科學家今天宣佈:我國已在全世界率先完成家蠶基因組“框架圖”繪製工作。這是我國科學家繼完成人類基因組1%測序工作、水稻基因組“框架圖”和“精細圖”之後,向人類貢獻的第三大基因組研究成果。
這也是迄今爲止我國科學家利用霰彈法測序完成的最大的生物種基因組,共註釋獲得了16948個完整基因,7285個基因片段。根據生物信息學的分析推斷,家蠶約有兩萬個基因, 其中約6000個基因爲新發現。課題組在家蠶基因組結構特徵、基因的組織、進化和比較基因組學方面,也獲得了一批具有重要價值的理論成果。
“框架圖”由中國工程院院士、西南農業大學教授向仲懷領銜,西南農業大學和中科院北京基因組研究所合作繪製完成。根據計算機組裝和數據分析結果表明,基因組測序完成了6倍的覆蓋深度,所獲序列覆蓋了家蠶基因組的95.54%,精確度達到了99.95%,完全達到了高質量工作“框架圖”的要求。
中國是世界蠶絲業的起源地。目前以現代科技爲核心,以基因組研究爲平臺,從家蠶入手,找到並構築一條以突破蠶業技術、根治鱗翅目類農林害蟲、開發生物藥品爲主要內容的“21世紀絲綢之路”,已成爲各國蠶業科學家的共識,併爲此展開了激烈的國際競爭。中國家蠶基因組計劃項目主持人、中國工程院院士向仲懷說:“我國率先向世界公佈第一個家蠶基因組‘框架圖’,標誌着我國在家蠶基因組研究方面已居世界領先地位,也是建立21世紀‘絲綢之路’的起點和里程碑。”
家蠶全基因組有4億5千萬個鹼基對,約爲人類全基因組的七分之一,略大於水稻基因組,但科研人員僅用了5個多月的時間就完成了從cDNA文庫構建到測序和組裝“框架圖”的所有工作,創下了基因組研究的最快紀錄,並且優化了基因組測序技術,大幅度降低了研究成本,提高了“框架圖”的質量和準確度。
有關專家介紹,“框架圖”的完成只是家蠶基因組研究和開發計劃的第一步,其“精細圖”預計在明年完成。科研人員將利用生物信息學的最新方法,對家蠶所擁有的所有基因進行註釋,開展重要功能基因的基礎和應用研究,並聯合國內科研單位,組成攻關隊伍,開展蠶絲產業化應用和模式昆蟲、醫學模式和生物工廠研究。
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