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臺灣當局“衛生署”30日表示，臺灣目前正值人的流感流行期，同時禽流感也在流行，所以這兩種病毒在臺灣混合、產生超級流感病毒的機會遠比其他地方大。控制住人流感、提防兩種病毒“碰頭”，已成爲主管部門的首要任務。
臺“疾病管制局”負責人表示，臺灣目前雖只檢驗出雞鴨低病原性的H5N2病毒，但卻有潛在的危機，首先是臺灣的養殖戶通常雞、鴨、豬都養，目前已發現雞傳染給鴨，如果再傳染給豬，產生新的流感病毒的風險將大增。因爲豬會感染人流感，一旦感染人流感的豬又感染來自雞、鴨的禽流感，那麼豬便成了病毒基因重組的培養場了。因此目前的低病原性禽流感輕視不得。
其次，臺灣目前正值人流感疫情逐漸上揚階段，人、禽流感病毒在臺灣混合、產生變種的風險很高。
據臺灣媒體報道，臺灣今年的人流感疫情目前看來是數十年來最弱的一次，但臺灣有關部門29日已決定，島內中小學於2月10日起開始全面量體溫，教員、學生如果發燒就不用上班、上課，這樣可以防止人流感快速傳播，也可降低人、禽流感病毒“碰頭”的機率。
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