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據中國衛生部消息，3月2日-3日，衛生部在廈門召開全國衛生應急工作會議，會議總結了2005年的衛生應急工作，並研究部署2006年的衛生應急工作。
王隴德對2006年的衛生應急工作進行了部署：1、明確職責、加強管理，完善衛生應急機制建設。2、依法規範、科學有序，完善衛生應急預案體系3、全員培訓、加強演練，提高預防和處置突發公共衛生事件的能力。4、加強監測、完善預警，加速突發公共衛生事件指揮系統的建設。5、加強準備、完善程序，有效處置突發公共衛生事件。6、廣泛宣傳、協調配合，完善聯防聯控機制7、依靠專家、加強合作，不斷提高衛生應急水平。8、貫徹精神、建立機制，有效開展反恐衛生應急工作。
王隴德強調，衛生應急工作要統籌安排，在加強突發公共衛生事件應急機制建設的同時，要重點抓好對公共衛生安全構成嚴重威脅的鼠疫、非典、人感染高致病性禽流感等疾病的防範和應對。要切實提高對新發傳染病、不明原因疾病等突發公共衛生事件的監測和處置能力，從而有效應對重大突發公共衛生事件。
針對鼠疫防控工作，王隴德指出，2006年是實施《全國鼠疫防治“十一五”規劃》的第一年，各地做好鼠疫防控工作，重點做到控制鼠疫動物疫情的擴散蔓延，防範人間病例的發生和傳播。各地要制定當地的防治規劃和工作計劃，並結合本地區疫源地分佈和近年疫情情況和防治工作實踐，完善本地區的鼠疫防控預案，開展主動監測，做好應急準備，有效處置突發疫情。
針對非典防控工作，王隴德指出，要按照提高警惕、常備不懈的原則，總結非典防控經驗，制定和完善非典防控應急預案和技術方案，科學規範非典監測和防控工作。協調有關部門進一步加大對野生動物市場監管和執法的力度，廣泛開展健康教育。各級醫療衛生機構進一步加強對不明原因肺炎病例的監測工作，及早發現、報告、篩查不明原因肺炎病例，及時識別非典疫情，防範疫情的擴散蔓延。要指定醫療機構做好收治非典病例的準備，防止醫源性感染髮生和疫情擴散，切實降低病死率。
針對人感染高致病性禽流感防控工作，王隴德指出，要樹立長期作戰思想，科學規範防控人感染高致病性禽流感。進一步加強全國人禽流感監測網絡和防控工作能力建設，完善人禽流感應急預案和防治技術方案，規範疫情防控和應急處置工作。各地應重點加強監測，提高預警能力，做好技術和物資儲備，提高快速反應能力。各級衛生行政部門要建立並長期保持與畜牧獸醫部門的溝通和合作機制，及時互通禽流感疫情信息，尤其要進一步加強基層部門間信息的及時、準確報告與溝通，確保人禽流感防控工作順利進行。
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