為保證侵華日軍南京大屠殺遇難同胞紀念館擴建工程的順利實施,紀念館將於2006年6月26日至2007年12月12日期間閉館,悼念南京大屠殺遇難同胞活動,可在漢中門、五臺山、清涼山等集體屠殺遺址和遇難同胞叢葬地舉行。閉館前夕,不少南京市民和外地游客紛紛前往紀念館悼念。