國家基因研究中心的科學家,順利完成了國際水稻基因組第四號染色體全長序列的精確測序任務。今天,科技部、中國科學院、上海市人民政府聯合宣佈稱,這是我國迄今爲止完成的最大的基因組單條染色體的精確測序。
伴隨這一工作的完成和發佈,水稻基因、染色體、鹼基對、測序、框架圖、物理圖等原本很專業的詞彙,又開始頻繁地進入人們的耳際與眼簾。與以往的採訪不同,引起記者關注的,不僅有許多的詞彙,還有大量的數字,而這些數字又傳遞着豐富的信息。
12條染色體與世界一半人口的生活
水稻是最重要的糧食作物之一,直接關係到世界一半人口的生活質量。而決定水稻品質與產量的,則是水稻的基因。
科學家證實,水稻共由12條染色體組成。在數千倍的顯微鏡下,染色體就像一條小小的線蟲。而這染色體“小線蟲”又依附着數千個基因。如果把12條染色體都弄清楚了,水稻的基因序列也就弄清楚了。
1998年,國際水稻基因組測序計劃正式啓動,中國以及臺灣地區與日本、美國、法國、韓國、印度等一道,成爲這一國際組織的成員。每個國家根據自身的經濟實力,除日本承擔6條染色體的測序外,其它國家與地區大都只承擔一條染色體的測序。
至今,只有中國和日本承擔的兩條染色體的測序工作得以完成,並獲得了精確的完成圖。日本測的是第1號染色體,中國測的是第4號染色體。反映這兩項工作的論文,同時在今天出版的世界權威的《自然》雜誌上發表。
國家基因研究中心主任韓斌博士說:“在穀類作物中,水稻因爲其基因組最小,而被國際上廣泛選爲模式生物,只要水稻基因的序列與功能清楚了,便可爲其它相關作物提供重要的信息。”
專家稱,獲得水稻基因4號染色體的序列分析結果,將有助於瞭解小麥、玉米等其它禾本科農作物的基因組,爲培育具有高產、優質、抗病蟲害、抗逆等優良性狀的水稻新品種打下良好基礎。
專家說,基因研究對水稻研究的影響是多方面的。比如以前人們水稻選種只能依靠目測,而通過基因研究,人們可以利用遺傳途徑改良水稻品種,水稻的選種時間也可以大大縮短。
10%的貢獻與90%的收穫
第4號染色體的序列,全長共有3500萬個鹼基對,約佔水稻基因12條染色體總量的10%。但是,實際工作中,卻測了3.5億個鹼基對。
根據國際水稻基因組織的協議,其成員必須將測序的所得數據提供給公共基因庫,同時,也可以分享他人的數據,和有關這一領域的先進技術與成果。這就意味着,中國水稻基因的測序研究,奉獻了10%的工作量,卻擁有了分享另外90%成果的資格。“我們是最大的國際合作的受益者。”韓斌博士反覆地強調這一點。基因中心已向公共數據庫遞交了超過5000萬鹼基的水稻基因組DNA序列數據。日本在水稻基因研究領域處於領先地位,而中國的第4號染色體與日本的第1號染色體工作同時刊出論文,這本身就是國際合作的結果。
在測序過程中,需要大量的探針,中國暫不具備成熟的產品。而日本從1992年就開始研究,探針的技術與產品已相當完備和成熟。根據協議,國家基因研究中心因此獲得了最好的探針,提高了測序的準確性。
“收穫不僅在此,還鍛鍊了一支隊伍。”韓斌說。參與4號染色體測序工作的研究人員達到了74人,平均年齡不到30歲。他們利用國際合作的機會,先後到日本、美國、韓國等著名實驗室工作與學習,瞄準了國際先進技術,迅速跟蹤了世界分子生物學的先進水平。有遠見的科學家認爲,在基礎研究領域,等到別人的論文出來了,再來跟蹤、學習是來不及的,那將失去與前沿對話的機會。
多項研究與一項決策
在今天舉行的新聞發佈會上,北京大學校長、中科院副院長、水稻基因組計劃領導小組成員許智宏院士很是激動。他說:“看到今天的成果,我特別高興。因爲這一研究經歷了許多難以想像的困難。”
中國的水稻基因研究1990年前後就開始醞釀,不過,要不要上這個項目,一開始就有爭論。主張不上的理由,主要是它太前沿,技術上難保證,投資也太大。現在我們可以拿出數億元來進行一個項目的研究,而在當時500萬元都是天文數字。”許智宏回憶。
中國科學院、科技部,廣泛聽取科學家的建議,還是決定克服困難,展開水稻基因研究。1992年,國務委員宋健在北京鄭重宣佈,中國正式啓動水稻基因組研究。1992年,科技部、中國科學院、上海市政府共同出資,在上海組建了中科院國家基因研究中心。
1993年,基因中心以中國主要栽培品種秈稻廣陸4號爲水稻基因組研究品系。1996年,我國在國際上率先完成了水稻(秈稻)基因組物理圖的構建。
隨後,我國科學家發現,國際上同時進行的水稻基因研究不是以秈稻爲主,而是以粳稻爲主。所以,中國科學家在國際學術交流中一度遇到冷落。因爲國際上的一些科學家估計,秈稻的基因組將比粳稻多出10%,研究成本會更大。
面對這種狀況怎麼辦?是單打獨戰,還是融入世界?在這樣的關頭,中科院、科技部又以遠見卓識決定,在秈稻研究的同時,融入世界,參與國際水稻基因研究合作。1998年,中國與其它10個國家一道,成爲國際水稻基因研究計劃成員,承擔了4號染色體的測序任務。科技部投入巨資,啓動這一工作,據稱,這是新中國成立以來投入最大的科研項目之一。
由於秈稻與粳稻並重,使得中國在水稻基因研究領域獲得全面豐收。今年4月,以華大基因爲主的中國科學家,獨立完成了秈稻基因組的工作框架圖,國際權威的《科學》雜誌刊登並介紹了這一研究成果。“今天,粳稻4號染色體的測序精確圖又在《自然》上發表,這充分說明,我國水稻基因組研究整體水平已經處於國際領先地位。”科技部副部長李學勇這樣評價。
更爲有價值的是,韓斌研究組在測序4號染色體的同時,還對另一個亞種秈稻廣陸矮4號染色體序列進行了測定,通過對兩個品種連續長度達230萬個DNA鹼基對相應序列的同源比較,首次報道了水稻兩個主要栽培稻(秈稻、粳稻)間的基因組成、順序及DNA基因水平上的一些異同,從而揭示了栽培稻間的一些親緣關係和進化關係。這是中國科學家在水稻基因研究領域的獨到貢獻。《自然》審稿人認爲:這些數據爲將來整個基因水平上的比較提供了一個良好的示範。
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