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科學研究綜合實力排名體現了各大學自然科學的理學、工學、農學、醫學4個學科，以及社會科學的哲學、經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、管理學7個學科的綜合實力的強弱。因此，僅在自然科學領域或僅在社會科學領域領先的大學，並不意味着一定能在科學研究綜合實力的評價中排名領先。《中國大學評價》課題組組長武書連認爲，自1987年中國科學學的先驅者、中國管理科學研究院趙紅州研究員、蔣國華教授等學者推出我國第一個大學科研評價，至今已有17年。在此期間，使用多種方法系統地研究過大學科研評價的學者已有上百人，發表的學術論文也有數百篇，大學科研評價的重要學術問題不斷得到解決。截至2002年，國內已經有了多個比較系統的科研評價體系，中國大學科研評價已經走向成熟。
2004中國大學科學研究綜合實力前100名
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排名
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等級
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校名
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| 1 |
A++ |
清華大學 |
| 2 |
A++ |
北京大學 |
| 3 |
A++ |
浙江大學 |
| 4 |
A++ |
復旦大學 |
| 5 |
A++ |
南京大學 |
| 6 |
A++ |
華中科技大學 |
| 7 |
A++ |
武漢大學 |
| 8 |
A+ |
上海交通大學 |
| 9 |
A+ |
中山大學 |
| 10 |
A+ |
吉林大學 |
| 11 |
A+ |
中國科學技術大學 |
| 12 |
A+ |
西安交通大學 |
| 13 |
A+ |
四川大學 |
| 14 |
A+ |
哈爾濱工業大學 |
| 15 |
A |
山東大學 |
| 16 |
A |
中國協和醫科大學 |
| 17 |
A |
天津大學 |
| 18 |
A |
南開大學 |
| 19 |
A |
中南大學 |
| 20 |
A |
北京師範大學 |
| 21 |
A |
東南大學 |
| 22 |
A |
華南理工大學 |
| 23 |
A |
北京航空航天大學 |
| 24 |
A |
廈門大學 |
| 25 |
A |
同濟大學 |
| 26 |
A |
上海第二醫科大學 |
| 27 |
A |
大連理工大學 |
| 28 |
A |
中國人民大學 |
| 29 |
A |
中國農業大學 |
| 30 |
A |
西北工業大學 |
| 31 |
A |
東北大學 |
| 32 |
A |
華東理工大學 |
| 33 |
A |
華東師範大學 |
| 34 |
A |
北京理工大學 |
| 35 |
A |
北京科技大學 |
| 36 |
A |
蘭州大學 |
| 37 |
B+ |
中國礦業大學 |
| 38 |
B+ |
重慶大學 |
| 39 |
B+ |
石油大學 |
| 40 |
B+ |
中國地質大學 |
| 41 |
B+ |
南京理工大學 |
| 42 |
B+ |
湖南大學 |
| 43 |
B+ |
南京航空航天大學 |
| 44 |
B+ |
南京農業大學 |
| 45 |
B+ |
西北農林科技大學 |
| 46 |
B+ |
蘇州大學 |
| 47 |
B+ |
暨南大學 |
| 48 |
B+ |
首都醫科大學 |
| 49 |
B+ |
西北大學 |
| 50 |
B+ |
武漢理工大學 |
| 51 |
B+ |
上海大學 |
| 52 |
B+ |
南京師範大學 |
| 53 |
B+ |
華中農業大學 |
| 54 |
B+ |
西安電子科技大學 |
| 55 |
B+ |
中國醫科大學 |
| 56 |
B+ |
華中師範大學 |
| 57 |
B+ |
鄭州大學 |
| 58 |
B+ |
電子科技大學 |
| 59 |
B+ |
西南交通大學 |
| 60 |
B+ |
東北師範大學 |
| 61 |
B+ |
中國海洋大學 |
| 62 |
B+ |
山西大學 |
| 63 |
B+ |
上海財經大學 |
| 64 |
B+ |
北京工業大學 |
| 65 |
B+ |
華南農業大學 |
| 66 |
B+ |
北京交通大學 |
| 67 |
B+ |
北京化工大學 |
| 68 |
B+ |
華南師範大學 |
| 69 |
B+ |
揚州大學 |
| 70 |
B+ |
山東農業大學 |
| 71 |
B |
雲南大學 |
| 72 |
B |
陝西師範大學 |
| 73 |
B |
湖南師範大學 |
| 74 |
B |
福建農林大學 |
| 75 |
B |
中南財經政法大學 |
| 76 |
B |
河海大學 |
| 77 |
B |
福州大學 |
| 78 |
B |
東華大學 |
| 79 |
B |
西南師範大學 |
| 80 |
B |
燕山大學 |
| 81 |
B |
河北大學 |
| 82 |
B |
太原理工大學 |
| 83 |
B |
北京郵電大學 |
| 84 |
B |
中國藥科大學 |
| 85 |
B |
南京工業大學 |
| 86 |
B |
北京林業大學 |
| 87 |
B |
哈爾濱醫科大學 |
| 88 |
B |
江蘇大學 |
| 89 |
B |
哈爾濱工程大學 |
| 90 |
B |
湖北大學 |
| 91 |
B |
廣東工業大學 |
| 92 |
B |
南京醫科大學 |
| 93 |
B |
天津醫科大學 |
| 94 |
B |
安徽大學 |
| 95 |
B |
首都師範大學 |
| 96 |
B |
青島大學 |
| 97 |
B |
昆明理工大學 |
| 98 |
B |
廣西大學 |
| 99 |
B |
東北林業大學 |
| 100 |
B |
南京林業大學 |
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