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隨着越來越多高校開始試點兩年制碩士，兩年制模式所引發的問題也逐漸凸現出來，引發了一場關於兩年制碩士是否可行的熱議。
教學環節設計上的時間相對縮短，可能對碩士生的知識結構有所不利。這是社會普遍關心的問題，也是爭論的焦點。
學生憂慮研一上基礎課程，研二就要忙於實習、找工作，實踐和科研方面易打折扣，對求職和今後的工作都有影響；導師擔心學生壓力太大，無暇顧及學術研究，不得不降低畢業論文的要求；企業質疑只經過兩年專業訓練的碩士生能否達到用人單位的要求，將兩年制碩士拒諸企業的門外。
各方的憂慮都有道理，於是乎，一時之間，兩年制碩士研究生從天之驕子陷入到高不成低不就的尷尬境地。
依照國際慣例，碩士學位是高等教育中的過渡性學位，學制一至二年。儘管中國目前纔剛剛步入高等教育大衆化階段，本科教育普及率與國外的一些國家仍有較大差距，然而隨着近年來高校的不斷擴張，中國的本科教育普及率正在逐步提升卻是一個不爭的事實，研究生改制與國際接軌是一個大趨勢。
許多實行碩士兩年制的高校也表示，縮短學制一方面可以節省國家教育資源，培養更多高層次的人才，另一方面可以改善研究生教育結構，重新定位碩、博培養功能。
雖然學制的縮短，可能會導致學而不精的情況出現，甚至會引起研究生培養模式的改變、研究生的質量滑坡，但各高校在推行碩士生兩年制改革時，一般都堅持對碩士學位的基本要求，採取提高學制效能的基本方式。大多數兩年制高校在壓縮學制的同時，更追求課程環節的前沿性和有效性，突出學術研究爲基礎的課程設計精神，有利於培養研究生的創新能力。
另外，學制的縮短，使得兩年制研究生能夠提前畢業，找工作的時候就能搶得先機。而中國對高層次的應用型人才的需求還有很大缺口，對技術更新和科技創新的要求也非常迫切，兩年制碩士研究生正是從事這項工作的中堅力量。
任何新生事物都有其發展過程，剛開始的時候都不會一帆風順，加上中國的實際國情，兩年制研究生試點工作尚處於摸索階段，遭遇到一定的困難是在所難免的。
社會應對兩年制研究生給予支持，對研究生改革給予鼓勵，使研究生培養制度和培養模式的改革能夠得到不斷深化。
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