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大港區結合天津市生態功能區規劃和本區特點，按照生態功能將大港區劃分爲四大生態功能區域，並將於2008年在全市率先達到生態區標準。
生物多樣性保護功能區位於大港區中心地帶，包括北大港水庫、官港湖、錢圈水庫、沙井子、獨流減河等，範圍基本覆蓋北大港溼地自然保護區核心區的全部範圍和部分，以及古貝殼堤自然保護區，面積355平方公里。
沿海灘塗與水產增殖生態功能區位於大港區南部和東部沿海，主要包括太平村、李二灣等淡水養殖區和海水養殖區以及沿海灘塗，面積約70平方公里。
城區及油田綜合發展生態功能區主要包括北部的大港城區、東部新城、大學城、石化基地、三角地和南部的油田生活區和生產區，面積約150平方公里。該功能區基本分爲三大類：生活功能區、教育功能區、工業生產區。
旱作和土壤鹽鹼化控制生態功能區包括太平鎮、小王莊鎮、趙連莊、港西街，獨流減河以西、防洪大堤以西等，以及以上三大功能區未包括的區域，面積約539平方公里。
另外，大港區還在生態功能區劃的基礎上，對具有水源涵養、水土保持、水源保護、防風固沙、生物多樣性保護等重要生態服務功能的區域確定爲重要生態功能區，即：北大港溼地生物多樣性保護重要生態功能區，海岸帶和灘塗重要生態功能區。
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