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對於此次太湖大規模藍藻爆發影響自來水供應問題，中科院南京地理與湖泊研究所研究員、太湖湖泊生態系統研究站站長鬍維平稱，“藍藻污染”早在4月份就已經爆發了，他們在本月初就擬定了原因分析及應急治理方案建議，提出提前採取措施，全面控制藍藻水華。同時，他還擔憂按照目前情況，如果不採取有效措施，太湖藻類水華可能持續近5個月。
胡維平介紹，去年以來氣溫偏高，而今年4月份太湖流域降水量明顯偏低，進而導致太湖水溫達到了25年來最高點，這就爲藻類提供了適宜的條件。另外，今年1-4月份偏南風風場顯著高於往年平均，使得其他湖區的藻類易於向太湖梅樑灣聚集。4月25日起梅樑湖暴發了大規模藻類水華，藻類水華暴發時間比過去提前近1個月。根據江蘇太湖湖泊生態系統國家野外科學觀測研究站的監測，5月2日藻類水華在梅樑湖全灣暴發。
胡維平還擔憂，鑑於目前整個太湖全湖平均氮磷含量分別高達4.0和0.13mg/L，藻類已經呈全湖性分佈，而且未來幾個月太湖水溫隨氣溫升高還將持續上升，水位如維持目前現狀，太湖藻類水華規模將進一步擴大，並持續近4-5個月時間，因此需採取必要措施降低藻類水華的危害。
爲此，他建議一方面採取必要的隔離措施，減少外源水華藍藻漂移進入景觀湖區；同時，在藍藻水華堆積的近岸區域，採用相對安全的改性粘土絮凝方法，沉降藍藻，消除藍藻在水面堆積、死亡與發臭，改善水質。具體做法爲：採用固體浮子式橡膠圍油欄，將梅樑灣主要景觀湖區與外太湖隔離，減少外來的湖面水華藍藻漂移進入該湖區，圍隔外側集聚水華藍藻的去除根據天氣預報，風向爲南風時圍欄關閉，並在圍欄外側的“鍋底”聚集藍藻，以便採用機械方式實施人工去除；在北風時，可以打開圍欄，以便景觀湖區內已經聚集藍藻水華可隨湖流向外漂移；藍藻水華堆積的近岸區域，採用改性高嶺土進行噴灑，使水面的藍藻沉降至湖底泥土中；在不影響防洪安全的前提下，利用太湖現有水利工程，控制太湖水體出流，通過望虞河引江通道自引和泵引方式增加入湖水量，將太湖水位由2.93m儘速提升至3.1-3.2米左右等。
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