據日本時事通訊社9月5日報道,日本首相小泉純一郎9月4日就日本海上發現疑爲朝鮮可疑船隻事件表示,他準備在日朝首腦會談時,與朝鮮領導人金正日討論這件事。
小泉當天說,“(將在首腦會談中)談論這次和過去的所有可疑船隻問題”。但他表示,“可疑船隻事件不會影響日朝首腦會談”。
另外,日本《讀賣新聞》報道稱,“日方拍攝的照片,確認了可疑船隻掛着表示朝鮮籍船隻的旗子”。但是,日本政府做出了由於可疑船隻發現在公海,沒有侵犯日本主權的結論。
9月17日,小泉將訪問朝鮮,與金正日舉行首腦會談。