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南開大學創辦於1919年，創辦人是著名愛國教育家張伯苓,(1876-1951)和嚴範孫(1860-1920)。
南開大學成立時，設文、理、商三科，招收學生96人，周恩來爲文科第一期學生(學號62號)。1920年增設礦科(1926年停辦)。1927年成立社會經濟研究委員會(後改稱經濟研究所)和滿蒙研究會(後改稱東北研究會)，經濟研究所趨重實地調查和以物價指數爲主的經濟統計工作，其出版的《經濟週刊》、《南開指數年刊》等多爲國內外學術界所借重。1929年改科爲院，設有文學院、理學院、商學院及醫預科，共13個系。1931年，商學院與文學院經濟系及社會經濟研究委員會合併成立經濟學院；創辦化學工程系和電機工程系，附屬於理學院；1932年設立應用化學研究所。
早期的南開大學作爲私立大學，其經費除政府少許補貼和學費及校產收入外，基本賴於基金團體和私人捐贈。本着“貴精不貴多，重質不重量”的原則以及投資所限，學校規模一直較小，1937年在校學生僅429人，但師資力量較強，凌冰(教育)、姜立夫、劉晉年(數學)、饒毓泰(物理)、邱宗嶽、楊石先(化學)、李繼侗、熊大仕(生物)、蔣廷(歷史)、李濟(人類學)、肖公權、徐謨(政治學)、何廉、方顯廷、陳序經、李卓敏(經濟)、黃鈺生(心理學)、張彭春(教育學)、柳無忌(英文)、司徒月蘭(英文)、馮文潛(哲學)、張克忠、張洪元(化工)等。竺可楨(氣象、地理)、湯用彤(哲學)、范文瀾(歷史)、羅隆基(政治)、吳大猷(物理)等也都曾在南開短期任教。
經過長期的艱苦創業，南開大學終以優越的學術環境、嚴謹的科學訓練方針以及崇尚務實的精神而名馳南北，爲國家和民族培養了一批優秀人才，周恩來、陳省身、吳大猷、曹禺等是其傑出代表。
1937年7月，正處於成熟發展時期的南開大學不幸慘遭日本侵略軍狂轟爛炸，三分之二的校舍被毀。同年8月，南開大學與北京大學、清華大學合組長沙臨時大學，三校校長張伯苓、蔣夢麟、梅貽琦爲常務委員，共主校務。翌年4月，長沙臨時大學遷往昆明，改稱西南聯合大學。1939年南開經濟研究所遷至重慶沙坪壩南開中學內，繼續開展研究工作，並招收研究生；1942年7月，南開在昆明成立“邊疆人文研究室”，並出版《邊疆人文》刊物。聯大期間，三校風雲際會，艱苦創業，和衷共濟，爲國家民族培養了一大批傑出的科學人才和革命志士，譜寫了中國教育史上的光輝篇章。
抗日戰爭勝利後，三校復員北歸，1946年南開大學遷回天津並改爲國立。覆校後設文學院、理學院、政治經濟學院和工學院，計16個系，另設有經濟研究所、應用化學研究所及邊疆人文研究室。師資力量有了加強，一批學者如吳大任、卞之琳、肖採瑜、傅築夫、高振衡、李廣田、羅大岡、汪德熙、謝國楨、張清常、王玉哲、楊生茂、司徒月蘭等來校任教。張伯苓在擔任校長長達30年之後，於1948年離任，由何廉代理校長。
1949年1月，天津解放，南開大學開始了新的歷程。黨和政府十分關心南開大學的發展，周恩來總理於1951年、1957年和1959年三次回母校視察；1958年毛澤東主席蒞校視察；1994年江澤民總書記視察南開；李鵬、朱鎔基等也曾先後視察南開，黨和國家領導人給南開師生以極大的鼓舞。
1952年全國高等學校院系調整，南開大學由一所學科比較齊全的大學變成了一所僅擁有文理學科的綜合性大學，設有14個系，3個專修科。院系調整後，鄭天挺、雷海宗、吳廷璆、李何林、朱維之、李霽野、季陶達、顧昌棟、溫公頤、陳仁烈、江安才、曾鼎禾、楊宗磐調入南開；王贛愚、何炳林、陳榮悌、陳茹玉、陳天池、王積濤、嚴志達、崔等一批國外留學者紛紛迴歸，相繼加入南開教席。1958年，南開大學的貿易、企業管理、會計、金融、財政、統計等系轉入新組建的天津財經學院。1960年設立地質地理系(1961年停辦)、物理二系(1961年轉入蘭州大學)和哲學系。80年代前，長期停滯於9個系的設置，即數學、物理、生物、化學、中文、外文、哲學、政治經濟學、歷史等系。
1966年至1976年，南開大學正常教學秩序被破壞。1966年至1971年教學、科研工作完全癱瘓，五年之久不招生、上課。1976年7月唐山大地震波及天津，學校大部分校舍遭到不同程度損壞。
改革開放以來，南開大學煥發青春活力。1980年以後，南開大學爲適應社會主義現代化建設需要，利用老專業基礎好的優勢，建立了一批新的專業和研究機構。文科重點增設了以財經類爲主的應用性專業，並在此基礎上於1983年恢復了經濟學院，理科重點增設了交叉、邊緣和高新科技類專業。到80年代中後期，南開大學發展成爲一所包括人文社會科學、自然科學、技術科學、生命科學、管理科學及藝術等多學科的綜合大學。1994年，天津對外貿易學院併入南開大學。
繼張伯苓之後，何廉、楊石先、臧伯平、滕維藻、母國光先後任南開大學校長，現任校長是侯自新。
南開大學是國家教育部直屬重點綜合性大學，是敬愛的周恩來總理的母校，歷來受到黨和國家的重視和關懷。毛澤東、周恩來、江澤民等黨和國家領導人曾先後視察南開大學。毛澤東主席親筆爲南開大學題寫校名，江澤民總書記爲南開大學題詞：
"發揚愛國敬業創新樂羣的光榮傳統，建設一流的社會主義大學"。
2000年12月25日，教育部和天津市人民政府簽署重點共建南開大學協議，南開大學躋身21世紀國家重點建設大學行列。
南開大學創建於1919年，創辦人是近代著名愛國教育家張伯苓和嚴修。抗日戰爭時期，南開大學與北京大學、清華大學在昆明組成舉世聞名的西南聯合大學，被譽爲"學府北辰"。
南開大學學科門類齊全，形成了文理並重、基礎寬厚、突出應用與創新的辦學特色。建有17個專業學院(系)，設有研究生院、成人教育學院、職業技術學院、現代遠程教育學院、泰達學院、經濟社會發展研究院及體育教學部。有61個本科專業，115個碩士點，75個博士點，13個博士後科研流動站。有18個國家重點學科, 13個省市級重點學科，8個國家基礎學科人才培養和科學研究基地以及1個文化素質教育基地，4個全國高校人文社會科學重點研究基地。
南開大學擁有一支陣容整齊、結構合理、學術精湛、銳意創新的師資隊伍。在1472餘名專任教師中，中國科學院院士和中國工程院院士7人，國務院學位委員會學科評議組成員9人，國家級有突出貢獻的專家14人，"長江學者獎勵計劃"特聘教授9人，天津市特聘教授1人，國家傑出人才基金獲得者10人，入選國家"百千萬人才工程"資助計劃教師9人，教育部跨世紀人才基金獲得者26人，博士生指導教師355人，教授465人，副教授594人。
南開大學具備培養學士、碩士、博士及博士後的完整教育體系。現有各類學生27907餘人，其中本科生10762人，專科生1144人，碩士研究生4406人，博士研究生1609人，留學生687人，成人教育在校生7681人，遠程教育學生1608人。
南開大學有着廣泛的國際影響，與美、日、英、法、德、俄等國家的一百多所大學和國際學術機構建立了合作與交流關係。數學大師陳省身在學校定居，身邊匯聚了一大批國內外知名的數學人才，使南開大學成爲國際數學重鎮之一。諾貝爾獎獲得者楊振寧、李政道、丁肇中以及美國前國務卿基辛格、韓國現任總統金大中等被聘爲名譽教授，並有一批海內外知名學者、著名企業家任兼職教授。
南開大學校園佔地1458694平方米，建築面積900989平方米。學校有先進的儀器設備和豐富的圖書資料。建有2個國家重點實驗室，1個國家工程中心和4個教育部重點實驗室。有中心實驗室、計算中心、網絡信息與教育技術管理中心及近百個教學實驗室。有兩個校級圖書館和多個專業圖書館，藏書總量達298.9萬冊。擁有在全國高校中具有一流水平的大型電子閱覽室，建成了覆蓋全校的計算機信息網絡，並與Internet、中國教育科研網等主幹網絡聯通，可隨時查詢、獲取國內外最新學術信息。爲方便學生的學習與生活，學校爲學生宿舍的每個房間安裝了直拔電話。與天津經濟技術開發區合作建設的南開大學泰達學院於2000年9月投入使用，這裏一流的設施和一流的管理爲培養學生的實踐創新能力提供了優越的環境。
南開大學既是教育教學中心，又是科學研究中心。在自然科學方面取得了一批國內外公認的研究成果，SCI論文數量居全國高校第7位，其中有機化學、農藥化學、基礎數學、應用數學和光學等領域都已達到國際先進水平，防僞識別等一批尖端高新技術的研究與開發爲我國現代化建設作出了貢獻。以南開戈德集團公司、南開允公集團公司爲首的一批高新技術企業利用學校多學科綜合優勢，積極參與市場競爭，成爲國家和地方高科技成果產業化的一支重要力量。南開大學國家大學科技園全新的管理模式和投資機制，爲師生創業提供一流的環境和服務。南開大學人文社會科學研究在全國高校中處於前列。在歷史、經濟、管理、哲學、中文等學科領域均取得了一批具有較高學術水平與廣泛社會影響的研究成果。APEC研究中心、經濟社會發展研究院等研究機構成爲國家部委和地方政府決策的"智囊團"和"人才庫"。
南開大學以鄧小平教育理論爲指導，突出和加強學生全面素質和創新能力的培養，提出了"注重素質、培養能力、強化基礎、拓寬專業、嚴格管理、保證質量"的教學指導思想，建立了完整的課堂教學、科學實驗、學術活動和社會實踐相結合的教學體系，實行學分制、主輔修制、雙學位制，增強選課、轉系轉專業的靈活性。1999年，南開大學順利通過教育部本科教學優秀學校評價，被評爲教育部本科教學工作優秀學校。根據教育部和天津市政府重點共建協議精神，南開大學將本着"獨立辦學、緊密合作"的原則，與天津大學開展全面合作，通過教師互聘、學生互相選課、學分互認等方式，開拓學生的知識視野，強化學生的理論基礎和實踐創新能力。學校設有獎學金30餘種，每年約有近半數學生從入校起即可享受到不同等級的獎學金，最高額度每年可達5000元。貸學金、困難補助、勤工助學以及社會各界人士的熱心捐助爲困難學生順利完成學業提供了有力的保障。南開大學以優良校風著稱，一貫重視學生德、智、體、美全面發展，爲青年學子的健康成長營造了豐富高雅、活潑向上的校園文化氛圍。南開畢業生以基礎紮實、素質全面、富於開拓精神和實踐能力而受到社會各界青睞。
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