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以一流科研隊伍和科研成果，彰顯一流大學整體實力的南開大學，新年伊始收穫了他們鍥而不捨堅持創新辦學與科研的成果。2005年度國家科技三大獎中，南大獲得3項自然科學二等獎(一等獎空缺)和1項科技進步二等獎，其中自然科學獎數量與清華並列全國高校首位。
南開大學校長侯自新在接受採訪時說：“榮獲國家科技大獎是學校多年堅持內涵式發展、堅持自主創新的成果。”近年來，南開大學明確提出了“求精、求強、注重特色”的發展思路，從2003年至今，南大連獲7項國家自然科學二等獎、1項技術發明二等獎和2項科技進步二等獎，覆蓋了數學、化學、物理、生命科學、環境科學、信息等學科，體現了綜合性研究型大學的優勢和特色。2003年以來，南開大學連續3年共獲7項國家自然科學二等獎，位居全國高校首位。
南開大學三年中的7項自然科學獎成果無不經歷過長期積澱，獲獎成果的研究過程最長的近30年，最短也達到12年之久。這其中每項成果都是老中青學者密切協作的成果，浸透了幾代科學家薪火相傳的心血，體現着南開學人一脈相承的科學精神與團隊精神。與此同時，南開大學的教師們還與其他單位強強聯合開展研究，取得了豐碩成果。化學學院教授嚴秀平作爲第二完成人與中科院專家合作的“有毒化學污染物形態研究中的聯用技術、方法學及相關機理”，環境科學與工程學院教授戴樹桂作爲第三完成人與中科院專家合作的“典型化學污染物環境過程機制及生態效應”，先後獲得2003年和2005年國家自然科學二等獎。爲科教興國事業做出重要貢獻的科技工作者，在南大也得到了崇高的榮譽。
學校每年向他們頒發科技成果特別獎，給予相應的配套獎勵，並對在國際各學科頂級期刊發表論文的教師給予獎勵。
激勵科研創新的機制和氛圍，使南開大學形成了銳意創新和善於攻關的人才梯隊。中青年學術骨幹近年來挑起大梁。陳瑞陽、廖代正2003年獲獎時分別爲70歲和64歲，2004年國家自然科學二等獎成果“辛道路的指標理論與在非線性哈密頓系統中的應用”第一完成人龍以明教授56歲，而2005年國家自然科學二等獎成果“光折變新效應、機理與器件的研究”第一完成人許京軍和“Atiyah-Singer指標理論的若干研究”完成人張偉平分別爲39歲和41歲，南開逐漸顯露出人才輩出的科研“後勁”。
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