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記者十二日晚從深圳市人民政府新聞辦公室獲悉，深圳市衛生部門採取措施迅速展開調查處理市兒童醫院醫療事件，深圳五家醫院對患兒搶救不利，終因循環呼吸衰竭、創傷性休克，導致患兒未及時治療死亡。
七月十二日，深圳市衛生局新聞發言人向省、市媒體通報了對事件的調查結果和處理意見。深圳市衛生局指出，市兒童醫院住院部當事醫生未對患兒進行仔細問診和檢查，沒有請示上級醫師和沒有執行會診及轉院制度，擅自決定讓病人退院去其他醫院做小兒腸鏡檢查，嚴重違反了醫療常規和制度，是事件的主要責任人，現已停止了該當事醫生的處方權，調離現工作崗位，等候進一步處理。
七月四日在深圳市兒童醫院發生一起醫療事件，涉及多家醫院。深圳市衛生局對此事件高度重視，經過認真調查，採取措施，停止市兒童醫院當事醫生的處方權並調離崗位等候進一步處理。同時召開市、區衛生部門負責人及各醫院業務院長會議，要求從中吸取教訓，舉一反三，確保類似事件不再發生。
七月十日，深圳市衛生局收到患兒家屬書面投訴後，立即由市局醫政處組織所涉五家醫院醫務科負責人進行調查，並要求市兒童醫院院領導牽頭成立專責小組，積極和患兒家屬保持溝通和聯繫，妥善處理善後事宜。
根據調查，七月四日下午十五時三十分左右，家屬帶患兒到深圳市兒童醫院，急診接診醫生進行肛指檢等檢查後收入住院。當班的住院醫生提出對患兒做腸鏡檢查。由於市兒童醫院的腸鏡已損壞，該醫生建議家屬帶患兒到其他醫院做腸鏡檢查。家屬帶患兒先後趕到北大深圳醫院、市婦幼保健院、市人民醫院，均未掛號就直接來到急診診室詢問能否做腸鏡檢查，該三家醫院均告知家屬不能做小兒腸鏡檢查。
隨後，家屬帶患兒趕到深圳市二醫院，經院內會診，行胸正側位X光片和腹部平片，CT等檢查，診斷患兒爲胸腹聯合傷，需行胸腹聯合探查手術。考慮到該院無小兒外科，患兒家屬再次選擇回到市兒童醫院手術治療，於二十二時四十分左右到達兒童醫院，急診手術探查腹腔、胸腔，行直腸修補術、胃修補術、隔肌修補術、胸腔閉式引流術、腹腔引流術等。但終因循環呼吸衰竭、創傷性休克，患兒於七月五日上午十一時三十分治療無效死亡。
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