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新華網長春2月26日電(記者常亦殊)中國醫學科學院藥用植物研究所所長陳士林教授日前在吉林長春表示,中國人參基因組計劃自2010年4月正式啟動以來,已完成人參根、莖、葉和花的轉錄組測序,並已發現所有與人參皂?合成相關?的候選基因。
陳士林介紹,中國人參轉錄組和人參皂?合成機制研究,處於世界領先水平。目前,研究人員已利用高通量測序技術對四倍體人參基因組進行測序,測序深度達到人參基因組大小的10倍以上;完成人參根、莖、葉和花的轉錄組測序,共獲得序列200多萬條;已發現所有與人參皂?合成相關?的候選基因,為闡明人參皂?的生物合成機制及人參皂?的代謝工程研究,奠定了堅實基礎。
他還介紹,人參基因組巨大,基因組重復序列多、復雜度高,為研究工作帶來巨大挑戰。研究表明,人參為高度雜合的4倍體,含48條染色體,一套染色體的大小約為3.2Gb,與人類基因組大小相似;其基因組GC含量約45%,重復序列比例約60%。以基因組大小僅為人參的1/10的黃瓜為例,我國研究者采用高通量測序方法,利用近3年時間,花費2000多萬元人民幣,纔完成基因組測序工作。可見,人參基因組計劃工作任務艱巨。
中國人參基因組計劃,由中國醫學科學院藥用植物研究所、中國農業科學院特產研究所、天津中醫藥大學等多家單位參與。該計劃包括:人參全基因組序列的初步測定和拼接,人參不同生長發育階段和不同組織部位轉錄組的測定和分析、人參基因組和轉錄組的注釋和功能基因發現,克隆和鑒定人參皂?生物合成和調控相關基因等。