綜合報道，臺灣漁民遭菲律賓公務船射殺事件已經過去一週，在臺灣方面採取連番反制措施後，菲律賓一方面表示正調查事件，如有過失者將嚴懲，另一方面堅持拒絕與臺灣方面合作查案，並因應臺灣方面的制裁。臺灣方面則繼續對菲方有關言論予以回擊。

　　馬英九稱漁船案是冷血謀殺 繼續交涉也盼和平解決

　　在臺灣方面祭出11項制裁措施之後，菲律賓不改強硬姿態，不但表示無須對臺灣方面低頭，更拒絕協助臺灣方面調查小組進行調查。馬英九16日深夜再次召集當局高層研商對策，決定先強勢反駁菲律賓總統府發言，17日不排除再提新的因應措施。

　　馬英九辦公室發言人李佳霏表示，菲律賓總統府的說法“罔顧事實、不能接受”；菲國公務船以自動武器掃射無武裝、未挑釁的臺灣漁船、殺害臺灣漁民，這是嚴重違法使用武力，顯然不是菲方聲稱“非蓄意的行爲”；臺灣方面無法接受這種令人憤慨的濫殺。

　　馬英九17日再度針對事件發表看法，認爲這整起事件就是一件冷血謀殺案。

　　馬英九表示，臺灣方面會跟菲律賓繼續交涉這個問題，同時他稱，希望大家都能夠很冷靜地、很和平地把這個問題解決。

　　臺灣地區外事部門17日也發佈新聞稿表示，菲國公務船非法使用武力，代表國家行爲，因此菲律賓政府負有國家責任。

　　外事部門表示，臺灣方面強烈抗議及譴責菲國公務船違法暴行，嚴正呼籲菲政府拿出誠意，必須正式道歉、賠償損失、儘速徹查事實嚴懲兇手等。

　　臺灣16日軍演結束後，菲律賓若仍未依臺灣方面的要求進行道歉，臺軍方表示，不排除配合臺灣當局第二波制裁，再升高軍事壓力，由海軍再派護漁艦隊南下對菲律賓進行火力展示。

　　爲強化對菲談判籌碼，臺灣海軍已規劃多套劇本，除艦隊護漁規模可視狀況調整，航路隨菲律賓反應機動，必要時更早已準備好火力展示計劃可逐步施壓，若菲律賓繼續“無賴”，只要高層令下，並由防務部門負責人同意第一擊，隨時可在海上開火。

　　菲再拒絕與臺灣方面合作查案 也稱若有過失者必嚴懲

　　菲律賓總統副發言人華爾特17日表示，菲國家調查局針對臺灣漁民被槍殺事件的調查正在進行之中，最終調查報告尚未出爐。

　　華爾特說，菲司法部長德利馬尚未就調查給出特定時間表，但已保證負責調查的菲國家調查局會把該調查列爲最優先事務處理。

　　菲國家調查局局長羅哈斯17日召開記者會。涉案的11名海岸防衛隊成員首度亮相，現場還陳列執法人員在事發當時持有的槍械，菲方表示將依證據辦案，如果查明菲方執法人員有過失，定予嚴懲。

　　羅哈斯指出，調查工作已於數日之前展開，國家調查局人員正不眠不休、以最優先級調查漁船射擊事件，且獲海岸防衛隊及漁業暨水產資源局充分配合，“相信以目前的速度而言，調查結果很快可以出爐”。

　　菲漁業與水產資源局17日則首度對外透露涉及事件的菲方公務船MCS3001船去向，聲稱該船已停航。

　　據悉，菲漁業與水產資源局會讓負責調查這起槍殺事件的菲國家調查局檢查MCS3001船，並向調查人員提供船上GPS(全球定位系統)繪圖儀等裝備的數據資料。

　　菲總統府17日記者會聲明，相信菲司法單位的調查結果，也不接受臺灣方面調查團進行聯合調查。

　　菲方希望臺灣方面要冷靜，一起解決這次爭端，避免再擴大問題。

　　此外，菲總統府方面稱，臺灣方面在“自家領海”和公海上進行軍演，對菲方的影響不大。

　　關於臺灣制裁菲勞工輸入政策，菲方說，目前會安排菲勞工輸出到韓國、中東以及馬來西亞等地。

　　部分西方媒體取態轉變 臺灣方面謀取輿論主動

　　國際媒體持續關注事件發展，但是部分媒體的態度在菲總統特使致歉後有所轉變，包括美聯社等媒體對於臺灣方面在菲總統特使致歉後，態度始終強硬，甚至展開軍演，感到相當不以爲然。

　　美聯社報道指，菲律賓方面兩次道歉，但是臺灣方面卻採取軍事演習，內文還講到馬英九當局民調低靡，是想利用這次的強硬態度，提振民衆對當局的信心。

　　爲了贏得輿論主動，臺灣地區外事部門負責人林永樂17日傍晚召開國際記者會表示，向菲律賓政府提出的要求，菲律賓至今的迴應不夠“正面、具體、充分”。

　　記者會上，臺灣方面秀出漁船被槍擊的照片，多達59個入口彈孔，連船底也有5顆子彈，但船體沒有撞擊痕跡。

　　臺灣方面表示，子彈方向大多集中在駕駛艙下方的機艙，同時死者受到高速槍傷，菲律賓持槍向非武裝船員掃射，有殺人的故意。

　　臺灣方面表示，記錄器顯示現場案發生狀況，船速由3.31節速度，加速到11節，可見受到槍擊加速自動離開，當時臺漁船沒有侵入菲律賓領海。

　　記者會背板以英文強調“這是冷血謀殺，不是‘非蓄意’的殺害”(It is a cold-blooded murder, not"unintended" killing)。