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昨日,華大基因研究院發佈最新研究進展,公佈了第三版的含有最新測序數據的大腸桿菌基因組完成圖譜,並且華大基因與其合作研究小組已研製出該大腸桿菌的診斷試劑盒,將無償提供檢測實驗方法細節及所需引物序列信息,給全球範圍內的病情診斷、疫情監測和污染源調查提供支持。
自5月中旬德國大腸桿菌疫情爆發以來,已對德國的公衆健康造成了嚴重的危害,疫情也正陸續蔓延至歐洲各地。全球科研工作者們正利用深圳華大基因研究院早前公佈的該大腸桿菌基因組序列信息積極的開展研究,爲早日結束這場疫情而共同努力。
華大基因的研究團隊整合了之前發表的Ion Torrent數據和基於Illumina公司Hiseq測序平臺新產生的數據,並進行序列拼接,從而得到第一個真正意義上基於從頭測序的組裝結果。這次新發表的全基因組組裝結果,比早前發佈的版本更加完整(完整度>99%)並且修正了之前可能出現的組裝錯誤。對該版本的基因組序列的分析也同樣證實了該大腸桿菌含有來自腸出血性大腸桿菌(EHEC)和腸黏附性大腸桿菌(EAEC)的致病基因。
基於之前的研究發現,華大基因與軍事醫學科學院微生物流行病研究所的科研人員迅速開展了針對該大腸桿菌的診斷試劑盒的研發。並且於昨日驗證完成了可快速檢測該大腸桿菌菌株的PCR診斷方案。該診斷方法主要通過兩對特異性引物的擴增,而鑑定出與黏附性及出血性相關基因結合。該方法可在收到樣品後2~3小時內提供診斷結果,其對疫情監控和和致病病菌的檢測起着重要作用。
華大基因對試劑盒的靈敏度和特異性進行數據分析及實驗測試,證明了該檢測方案具有高度特異性。靈敏度實驗檢測結果也表明,該方法在DNA濃度低至約1皮克(10~12克)的反應體系中仍可檢測出該菌株。更多的驗證試驗將會在本週繼續開展。同時,爲了更好地控制此疫情的傳播,華大基因與軍事醫學科學院微生物流行病研究所將免費爲全球疾病控制和研究機構提供合成引物,爲監控及預防全球範圍內疫情的擴散提供幫助。
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深圳診斷試劑盒向全球提供支持
華大基因研製出德國大腸桿菌診斷試劑盒,3小時內可提供診斷結果,合成引物將免費提供
自5月中旬德國大腸桿菌疫情暴發以來,德國的公衆健康已受到了嚴重的危害,疫情也正陸續蔓延至歐洲各地。6月7日,深圳華大基因研究院又發佈最新研究進展,公佈了第三版的含有最新測序數據的大腸桿菌基因組完成圖譜。據悉,華大基因與其合作研究小組已研製出該大腸桿菌的診斷試劑盒,將無償提供檢測實驗方法細節及所需引物序列信息,給全球範圍內的病情診斷、疫情監測和污染源調查提供支持。目前,全球科研工作者們正利用深圳華大基因研究院早前公佈的該大腸桿菌基因組序列信息積極地開展研究。
記者在採訪中獲悉,深圳華大基因研究院昨天又發佈針對德國大腸桿菌疫情的最新研究進展,公佈了第三版的含有最新測序數據的大腸桿菌基因組完成圖譜。華大基因的研究團隊整合了之前發表的Ion Torrent數據和基於Illumina公司Hiseq測序平臺新產生的數據,並進行序列拼接,從而得到第一個真正意義上基於從頭測序的組裝結果。這次新發表的全基因組組裝結果,比早前發佈的版本更加完整(完整度>99%),並且修正了之前可能出現的組裝錯誤。對該版本的基因組序列的分析也同樣證實了該大腸桿菌含有來自腸出血性大腸桿菌(EHEC)和腸黏附性大腸桿菌(EAEC)的致病基因。
基於之前的研究發現,華大基因與軍事醫學科學院微生物流行病研究所的科研人員迅速開展了針對該大腸桿菌的診斷試劑盒的研發,並且於昨天驗證完成了可快速檢測該大腸桿菌菌株的PCR診斷方案。該診斷方法主要通過兩對特異性引物的擴增,鑑定出與黏附性及出血性相關的基因。據稱,該方法可在收到樣品後2~3小時內提供診斷結果,其對疫情監控和和致病病菌的檢測起着重要作用。
據瞭解,華大基因對試劑盒的靈敏度和特異性進行數據分析及實驗測試,證明了該檢測方案具有高度特異性。靈敏度實驗檢測結果也表明,該方法在DNA濃度低至約1皮克(10~12克)的反應體系中仍可檢測出該菌株。華大基因方面透露,更多的驗證試驗將會在本週繼續開展。同時,華大基因與軍事醫學科學院微生物流行病研究所將免費爲全球疾病控制和研究機構提供合成引物。